在生物學(xué)研究中,乳酸化修飾和能量代謝是兩個(gè)看似獨(dú)立卻又緊密相連的概念。乳酸化修飾是一種重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的活性和功能,進(jìn)而影響細(xì)胞的能量代謝和信號(hào)傳導(dǎo)等多個(gè)方面。能量代謝作為細(xì)胞生命活動(dòng)的核心,其中乳酸是人體細(xì)胞能量代謝的重要產(chǎn)物,乳酸的積累促進(jìn)了組蛋白賴(lài)氨酸發(fā)生乳酸化修飾。
為全面研究乳酸化修飾與能量代謝的復(fù)雜關(guān)系,拜譜生物提供了乳酸化修飾蛋白組學(xué)+靶向能量代謝組學(xué)多組學(xué)解決方案及技術(shù)服務(wù),結(jié)合蛋白組學(xué)、修飾組學(xué)、代謝組學(xué)等技術(shù),系統(tǒng)解析機(jī)體表型與疾病機(jī)制的關(guān)系,揭示疾病發(fā)生機(jī)制,為開(kāi)發(fā)新的診斷和治療策略提供新途徑。
下面我們將深入探討乳酸化修飾與能量代謝關(guān)系,并探討其在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用前景。
/拜譜多組學(xué)解決方案/
能量代謝
細(xì)胞內(nèi)的代謝過(guò)程是其生命活動(dòng)的核心,它不僅促進(jìn)細(xì)胞的發(fā)育和成熟,還調(diào)控著細(xì)胞的功能。能量的產(chǎn)生主要依賴(lài)于營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)如葡萄糖和脂肪酸在無(wú)氧和有氧條件下的代謝,這些過(guò)程不僅為生物體提供生存所需的能量,還為細(xì)胞合成復(fù)雜的生物分子提供原料。在哺乳動(dòng)物體內(nèi),細(xì)胞通過(guò)有氧呼吸和糖酵解兩種主要途徑來(lái)獲取能量。有氧呼吸主要在細(xì)胞的線粒體內(nèi)發(fā)生,通過(guò)消耗氧氣將營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)如糖、脂肪和蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化為能量,同時(shí)產(chǎn)生大量的ATP。因此,線粒體常被形象地稱(chēng)為細(xì)胞的“能量工廠”。另一方面,糖酵解則是在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行的一種無(wú)氧代謝過(guò)程,它將葡萄糖轉(zhuǎn)化為乳酸并產(chǎn)生較少的ATP。這兩種代謝途徑是細(xì)胞能量生成的關(guān)鍵,大多數(shù)細(xì)胞能夠根據(jù)環(huán)境的變化靈活地在這兩者之間進(jìn)行切換。值得注意的是,腫瘤細(xì)胞更傾向于通過(guò)糖酵解來(lái)獲取能量,而不是通過(guò)有氧呼吸,這種代謝方式與正常細(xì)胞存在顯著差異,這種現(xiàn)象被命名為Warburg效應(yīng)。
圖源:Ly et al., Cell Metab, 2020
乳酸化修飾
細(xì)胞代謝產(chǎn)生的許多小分子不僅作為重要的底物和能量來(lái)源,還能參與細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)和基因表達(dá)調(diào)控。乳酸,作為能量代謝的核心物質(zhì),不僅是能量轉(zhuǎn)換的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物,而且在維持細(xì)胞和組織的能量平衡方面具有決定性作用。腫瘤的Warburg效應(yīng)不僅為癌細(xì)胞提供了快捷的能量來(lái)源,而且所產(chǎn)生的乳酸在腫瘤微環(huán)境中展現(xiàn)出多樣的功能,不僅有利于癌細(xì)胞的存活與增殖,還可以作為信號(hào)分子,參與調(diào)控細(xì)胞周期、增殖和存活等核心生物學(xué)過(guò)程。這種能量供應(yīng)與信號(hào)傳導(dǎo)的雙重作用,使乳酸在癌細(xì)胞的生物學(xué)行為中實(shí)現(xiàn)了調(diào)控效果。在細(xì)胞代謝過(guò)程中,乳酸的積聚可以促使組蛋白賴(lài)氨酸發(fā)生乳酸化修飾。這種修飾具有動(dòng)態(tài)可逆的特性,能夠迅速對(duì)細(xì)胞內(nèi)外環(huán)境的變化做出響應(yīng)。乳酸化修飾在癌癥細(xì)胞中廣泛存在,與癌癥的發(fā)生、發(fā)展和治療抵抗密切相關(guān)。大量研究顯示,乳酸化修飾可以通過(guò)調(diào)控信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、基因表達(dá)、能量代謝、免疫反應(yīng)、血管生成以及DNA損傷修復(fù)等關(guān)鍵途徑和機(jī)制,影響腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)。
圖源:Lu et al., Frontiers in Genetics, 2024
當(dāng)前,在腫瘤領(lǐng)域研究中,為了抑制乳酸化修飾以遏制腫瘤的生長(zhǎng),可以從以下幾個(gè)方面入手。首先,通過(guò)抑制乳酸生成的策略來(lái)干預(yù)腫瘤細(xì)胞的代謝途徑。利用特定的藥物或改變腫瘤微環(huán)境,可以降低乳酸的生成,從而在源頭上控制乳酸化修飾的出現(xiàn)。其次,抑制乳酸化酶的活性可以直接影響乳酸化修飾的水平。乳酸化酶作為催化乳酸化修飾的關(guān)鍵酶,其活性的抑制將阻斷乳酸與蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)合,從而減少乳酸化修飾的發(fā)生。此外,深入研究乳酸化修飾的調(diào)控機(jī)制,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和表觀遺傳調(diào)控,揭示新的靶點(diǎn),對(duì)這些靶點(diǎn)的干預(yù)可能為抑制乳酸化修飾提供新的治療手段。進(jìn)一步地,研究特異性的乳酸化抑制劑,也可以直接阻斷乳酸化修飾的過(guò)程,為癌癥治療提供更為精準(zhǔn)的干預(yù)。除腫瘤領(lǐng)域之外,乳酸化涉及多種細(xì)胞過(guò)程,包括神經(jīng)興奮、胚胎發(fā)育、免疫抑制、肺纖維化和代謝。表1中總結(jié)了參與乳酸化的關(guān)鍵底物及其相應(yīng)的生理病理功能。
圖源:Lu et al., Frontiers in Genetics, 2024
應(yīng)用場(chǎng)景
1. 癌癥:腫瘤細(xì)胞代謝異常,乳酸生成增多,導(dǎo)致乳酸化修飾水平升高,可以作為癌癥診斷的潛在標(biāo)志物。
2. 炎癥性疾病:乳酸化修飾可以調(diào)節(jié)炎癥細(xì)胞的活化和炎癥因子的表達(dá),影響炎癥反應(yīng)的進(jìn)程。
3. 神經(jīng)退行性疾病:神經(jīng)退行性疾病的發(fā)生和發(fā)展與神經(jīng)炎癥和神經(jīng)元死亡密切相關(guān),乳酸化修飾可能參與其中。
4. 纖維化疾病:纖維化疾病的發(fā)生和發(fā)展與成纖維細(xì)胞的活化和膠原沉積密切相關(guān),乳酸化修飾可能參與其中。
5. 糖尿病:胰島素抵抗和糖尿病并發(fā)癥的發(fā)生與發(fā)展與細(xì)胞能量代謝異常密切相關(guān)。
6. 心血管疾病:心血管疾病的發(fā)生和發(fā)展與血管功能和心肌能量代謝異常密切相關(guān)。
7. 骨骼疾病: 骨質(zhì)疏松的發(fā)生與發(fā)展與骨能量代謝異常密切相關(guān)。
拜譜小結(jié)
乳酸化修飾與能量代謝等研究,為疾病發(fā)生、發(fā)展和治療中的作用提供了新的視角,為未來(lái)的研究方向和疾病治療的發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。拜譜生物可提供乳酸化修飾組、靶向能量代謝等多組學(xué)聯(lián)合技術(shù)服務(wù)產(chǎn)品,助力癌癥等機(jī)制機(jī)理、疾病治療等研究。拜譜生物,作為國(guó)內(nèi)領(lǐng)先的多組學(xué)公司,可提供完善成熟的蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等多組學(xué)產(chǎn)品技術(shù)服務(wù)體系。結(jié)合多組學(xué)技術(shù),拜譜生物也、推出了針對(duì)不同樣本和研究領(lǐng)域的多組學(xué)研究方案,包括腸道篇、血液篇、醫(yī)學(xué)篇等,幫助客戶(hù)解決研究難題,助力多篇高分文章的發(fā)表。歡迎大家咨詢(xún)!
參考文獻(xiàn):
[1] Chen H, Li Y, Li H, Chen X, Fu H, Mao D, Chen W, Lan L, Wang C, Hu K, Li J, Zhu C, Evans I, Cheung E, Lu D, He Y, Behrens A, Yin D, Zhang C. NBS1 lactylation is required for efficient DNA repair and chemotherapy resistance. Nature. 2024. doi: 10.1038/s41586-024-07620-9
[2] De Leo A, Ugolini A, Yu X, Scirocchi F, Scocozza D, Peixoto B, Pace A, D'Angelo L, Liu JKC, Etame AB, Rughetti A, Nuti M, Santoro A, Vogelbaum MA, Conejo-Garcia JR, Rodriguez PC, Veglia F. Glucose-driven histone lactylation promotes the immunosuppressive activity of monocyte-derived macrophages in glioblastoma. Immunity. 2024; 57(5):1105-1123.e8. doi: 10.1016/j.immuni.2024.04.006
[3] Chen Y, Wu J, Zhai L, Zhang T, Yin H, Gao H, Zhao F, Wang Z, Yang X, Jin M, Huang B, Ding X, Li R, Yang J, He Y, Wang Q, Wang W, Kloeber JA, Li Y, Hao B, Zhang Y, Wang J, Tan M, Li K, Wang P, Lou Z, Yuan J. Metabolic regulation of homologous recombination repair by MRE11 lactylation. Cell. 2024; 187(2):294-311.e21. doi: 10.1016/j.cell.2023.11.022
[4] Lu Z, Zheng X, Shi M, Yin Y, Liang Y, Zou Z, Ding C, He Y, Zhou Y, Li X. Lactylation: The emerging frontier in post-translational modification. Front Genet. 2024 Jun 27;15:1423213. doi: 10.3389/fgene.2024.1423213
[5] Ly CH, Lynch GS, Ryall JG. A Metabolic Roadmap for Somatic Stem Cell Fate. Cell Metab. 2020 Jun 2;31(6):1052-1067. doi: 10.1016/j.cmet.2020.04.022
[6] Sun L, Zhang Y, Yang B, Sun S, Zhang P, Luo Z, Feng T, Cui Z, Zhu T, Li Y, Qiu Z, Fan G, Huang C. Lactylation of METTL16 promotes cuproptosis via m6A-modification on FDX1 mRNA in gastric cancer. Nat Commun. 2023; 14(1):6523. doi: 10.1038/s41467-023-42025-8
[7] Zong Z, Xie F, Wang S, Wu X, Zhang Z, Yang B, Zhou F. Alanyl-tRNA synthetase, AARS1, is a lactate sensor and lactyltransferase that lactylates p53 and contributes to tumorigenesis. Cell. 2024; 187(10):2375-2392.e33. doi: 10.1016/j.cell.2024.04.002