基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程通常包括多個步驟,包括細(xì)胞裂解、蛋白提取、消化和脫鹽,不同的步驟帶來了一些挑戰(zhàn),包括潛在的樣品污染和損失,重復(fù)性等問題,阻礙了微量樣本的質(zhì)譜檢測。盡管已經(jīng)開發(fā)了多種針對微量樣本的前處理流程,如SISPROT、SP3等,但是這種方法對極微量樣本的蛋白檢出量有限。
基于此,拜譜生物全新推出了極微量蛋白質(zhì)組學(xué),采用一步樣品制備法,實現(xiàn)“0”損耗,結(jié)合最新的Astral質(zhì)譜儀突破至數(shù)個細(xì)胞的檢測限度,100個細(xì)胞可穩(wěn)定鑒定出6000+蛋白,實現(xiàn)蛋白的高質(zhì)量檢出,挖掘特殊樣本的重要信息,助力疾病機(jī)制解析,推動生物醫(yī)藥的發(fā)展
極微量蛋白質(zhì)組通過一步樣本制備法實現(xiàn)細(xì)胞的裂解、酶解、脫鹽一體化,在1管中完成了制備的所有流程,避免了樣本轉(zhuǎn)移造成的損失,達(dá)到幾乎0損耗。為流式分選的細(xì)胞、原代培養(yǎng)的細(xì)胞、臨床穿刺組織、房水等特殊樣本提供了解決辦法,提高了樣本鑒定深度和準(zhǔn)確性,為極微量樣本的研究提供了重要的工具。
極微量蛋白質(zhì)組學(xué)的實測數(shù)據(jù)如圖所示,基于Astral對細(xì)胞樣本測試,在100個細(xì)胞中實現(xiàn)了6600+的蛋白檢出,在1000個細(xì)胞中突破至8500+的蛋白檢出,實現(xiàn)了低樣本量,高檢出量,打開了極微量世界的大門。同時,進(jìn)一步的相關(guān)性分析表明樣本間具有較高的相關(guān)性,數(shù)據(jù)質(zhì)量較高。
拜譜生物購入了世界一流的Orbitrap Astral質(zhì)譜儀,大大提高了數(shù)據(jù)的檢出質(zhì)量,實現(xiàn)了更高通量、更深覆蓋、更高靈敏度、更精準(zhǔn)定量和更高穩(wěn)定性與重現(xiàn)性。同時拜譜生物能夠為客戶提供全流程服務(wù),包括方案設(shè)計、技術(shù)指導(dǎo)、高級豐富的生信分析服務(wù)等。
質(zhì)譜儀和豐富的生信分析
樣本類型 | 推薦送樣量 |
細(xì)胞 |
100-1000個 |
動物組織 | 500μg |
體液 | 50μL |