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微生物多樣性
微生物多樣性通過檢測細(xì)菌16S rRNA的基因可變區(qū)序列、真菌18S rRNA的基因可變區(qū)序列或真菌的內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)序列的變異和數(shù)量,獲取微生物群落的多樣性和組成譜。二代測序是比傳統(tǒng)生化鑒定更先進(jìn)的鑒定方法;DNA測序不依賴菌種本身特點,對所有菌種均可使用;比傳統(tǒng)生化鑒定更加快速,準(zhǔn)確。
微生物多樣性
實驗流程
拜譜生物提供服務(wù)
01
細(xì)菌16S rDNA測序
利用細(xì)菌16SrDNA序列測序的方法對細(xì)菌進(jìn)行種屬鑒定
02
真菌18S rDNA測序
18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列
03
真菌ITS測序
通過將測序得到的ITS序列與已知真菌ITS序列比較,從而獲得待測真菌種屬信息的一種方法
04
三代全長測序
DNA測序時,不需要經(jīng)過PCR擴(kuò)增,實現(xiàn)了對每一條DNA分子的單獨測序
應(yīng)用方向
01
疾病標(biāo)志物篩查
02
疾病機制研究
03
藥理及藥效分析
04
環(huán)境研究
送樣建議
樣本類型
常規(guī)送樣量
生物學(xué)重復(fù)
保存/運輸方式
土壤、污泥
≥3g
≥3例(臨床樣本≥10例)
液氮速凍
-80℃保存
干冰運輸
胃液/組織液
≥3ml
糞便/腸道內(nèi)容物
≥0.5g
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