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4D蛋白質(zhì)組
在3D定量技術(shù)中,主要根據(jù)保留時(shí)間(Retention time)、質(zhì)荷比(m/z)和強(qiáng)度(Intensity)三個(gè)維度的性質(zhì)對(duì)肽段進(jìn)行定性和定量。離子淌度(Ion Mobility)概念的引入使蛋白質(zhì)組學(xué)進(jìn)入了4D新時(shí)代,在m/z維度上無法分離的離子可以根據(jù)離子淌度得以分離。4D蛋白質(zhì)組學(xué)基于timsTOF Pro質(zhì)譜平臺(tái),將數(shù)據(jù)依賴性采集(DDA)、數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA)或平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(PRM)與同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)技術(shù)相結(jié)合。第四維度的離子淌度依據(jù)離子大小和形狀,或者更準(zhǔn)確地說是離子的碰撞截面積(Collisional cross section,CCS)來實(shí)現(xiàn)對(duì)離子的分離,實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確高效的4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)。4D-蛋白質(zhì)組學(xué)以更少上樣量,實(shí)現(xiàn)高速度、高靈敏度、高通量、高覆蓋度的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè),并在基礎(chǔ)研究、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、臨床蛋白質(zhì)組學(xué)等各個(gè)方面展現(xiàn)出了廣闊的發(fā)展前景和強(qiáng)大的生命力。

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4D-蛋白質(zhì)組學(xué)示意圖


4D蛋白質(zhì)組
實(shí)驗(yàn)流程

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應(yīng)用場(chǎng)景與技術(shù)優(yōu)勢(shì)

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產(chǎn)品
  • 01
    產(chǎn)品類型:4D-label free
    采集模式以及應(yīng)用方向:DDA+PASEF;適于各類樣本,尤其是微量樣品:細(xì)胞、血液、石蠟切片等
  • 02
    產(chǎn)品類型:4D-DIA
    采集模式以及應(yīng)用方向:DIA+PASEF;適于大規(guī)模樣本研究:臨床大對(duì)列樣本等
  • 03
    產(chǎn)品類型:4D-PRM
    采集模式以及應(yīng)用方向:PRM + PASEF;非靶蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)可靠性驗(yàn)證,biomarker或功能驗(yàn)證

送樣建議
樣本類型 4D--蛋白質(zhì)組學(xué)
動(dòng)物組織 >50mg
植物組織 >200mg
細(xì)胞樣品 >1x10^7
血液、腦脊液等體液 >100μl
微生物類(菌類) >50mg
參考文獻(xiàn)

1.Tian W, Zhang N, Jin R, et al. Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020;11(1):5859. Published 2020 Nov 17. doi:10.1038/s41467-020-19706-9

2.Zandalinas SI, Song L, Sengupta S, et al. Expression of a dominant-negative AtNEET-H89C protein disrupts iron-sulfur metabolism and iron homeostasis in Arabidopsis. Plant J. 2020;101(5):1152-1169. doi:10.1111/tpj.14581

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