TMTTM(Tandem Mass TagTM)技術(shù)是由美國Thermo Scientific公司研發(fā)的一種多肽體外標記技術(shù)。該技術(shù)采用2種、6種或10種同位素的標簽,通過特異性標記多肽的氨基基團,然后進行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時比較2組、6組或10組不同樣品中蛋白質(zhì)的相對含量。
TMT試劑由三部分組成:報告基團、平衡基團和反應(yīng)基團。反應(yīng)基團形成2—10種等質(zhì)量同位素標簽。TMT試劑標記酶解后的肽段,可與氨基酸N端及側(cè)鏈的伯胺基團發(fā)生反應(yīng)。在一級譜圖中,來自于不同樣本的同一肽段,標記后表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。在二級譜圖中,報告基團、平衡基團和反應(yīng)基團之間的鍵斷裂,帶不同同位素標簽的同一肽段產(chǎn)生質(zhì)量不同的報告離子,根據(jù)報告離子的豐度可獲得樣本間相同肽段的定量信息,再經(jīng)過軟件處理得到蛋白質(zhì)的定量信息。
圖.TMT標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線示意圖
疾病標志物篩選、疾病控制機制、藥物作用靶點研究、發(fā)育機制研究、產(chǎn)量提高、作用機制研究、植物抗逆、營養(yǎng)吸收機制研究、稀有物種研究、特殊功能蛋白質(zhì)篩選。
樣本類型 | 樣本要求 |
植物葉片 | 濕重≥0.2g |
植物根莖、木質(zhì)郁韌皮部等 | 溫重≥5g |
細胞樣品 | ≥細胞量2x10^7 |
組織樣品 | 人、動物、微生物濕重≥50mg |
體液樣品 | 血清、血漿體積≥100μl,腦脊液≥200μl,尿液≥10ml |
1. Zhang G, Xue W, Dai J, et al. Quantitative proteomics analysis reveals proteins and pathways associated with anthocyanin accumulation in barley. Food Chem. 2019;298:124973. doi:10.1016/j.foodchem.2019.124973
2. Hu Y, Li M, Liu Z, Song X, Qu Y, Qin Y. Carbon catabolite repression involves physical interaction of the transcription factor CRE1/CreA and the Tup1-Cyc8 complex in Penicillium oxalicum and Trichoderma reesei. Biotechnol Biofuels. 2021;14(1):244. doi:10.1186/s13068-021-02092-9
3. Liu J, Liu D, Wu X, Pan C, Wang S, Ma L. TMT Quantitative Proteomics Analysis Reveals the Effects of Transport Stress on Iron Metabolism in the Liver of Chicken. Animals (Basel). 2021;12(1):52. doi:10.3390/ani12010052