在醫(yī)學領(lǐng)域,藥物抗性問題日益嚴峻,它不僅限制了抗腫瘤、抗微生物和抗病毒藥物的療效,也對公共衛(wèi)生安全構(gòu)成了巨大挑戰(zhàn)。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾(PTMs),包括磷酸化、泛素化、乙?;?,是細胞內(nèi)調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能的重要機制。這些修飾通過改變蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性、活性和相互作用,深刻影響著細胞的生物學過程,包括藥物的敏感性。
2024年11月21日,Drug Resistance Updates發(fā)表了一篇綜述,由香港大學Yibin Feng領(lǐng)銜的研究團隊撰寫,題為“Post-translational modifications in drug resistance”,該綜述不僅闡述了多種翻譯后修飾在藥物耐藥性中的重要作用,還討論了PTMs如何作為耐藥性的誘導(dǎo)因素和逆轉(zhuǎn)靶點,為探索耐藥機制、開發(fā)新藥物靶點和指導(dǎo)治療方案提供了新的思路。
PTMs的生物學角色
PTMs是指通過共價添加功能基團、調(diào)節(jié)亞基蛋白水解切割或降解整個蛋白質(zhì)來增加蛋白質(zhì)組功能多樣性的過程。PTMs是細胞內(nèi)蛋白質(zhì)功能調(diào)控的重要機制,涉及多種類型的化學修飾。這些修飾可以是永久性的,也可以是可逆的,它們參與調(diào)控蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性、活性、亞細胞定位以及與其他分子的相互作用。不僅在細胞信號傳導(dǎo)、代謝調(diào)控等生理過程中發(fā)揮作用,也在疾病的發(fā)生發(fā)展中扮演關(guān)鍵角色。
PTMs與藥物耐藥性
耐藥性是藥物治療中一個普遍存在的問題,它涉及病原體或腫瘤細胞對藥物的反應(yīng)降低或完全消失。耐藥性的產(chǎn)生是一個復(fù)雜的過程,可能涉及多種因素,包括遺傳變異、藥物使用不當、病原體或腫瘤細胞的適應(yīng)性改變等。PTMs與耐藥性之間存在著密切的關(guān)系。PTMs是細胞內(nèi)信號傳導(dǎo)和基因表達調(diào)控的重要機制,它可以通過改變蛋白質(zhì)的功能和活性來影響藥物的效果。因此,PTMs可以作為逆轉(zhuǎn)耐藥性的靶點或開發(fā)新藥物的目標。通過針對特定的PTM,可以開發(fā)出新的藥物或藥物組合,以提高治療效果并克服耐藥性。
圖1 PTMs與藥物耐藥性(圖源:Miao, et al., Drug Resist Updat, 2024)
PTMs在抗腫瘤藥物耐藥性中的作用
惡性腫瘤是目前人類預(yù)期壽命的最大障礙。化療、靶向治療和免疫治療是抗腫瘤治療的重要手段。而惡性腫瘤易發(fā)生耐藥性,預(yù)后差。耐藥性腫瘤細胞展現(xiàn)出多種適應(yīng)性變化,包括旁路代謝途徑的增強、下游信號級聯(lián)的活化、腫瘤抗原表達的下降、DNA修復(fù)機制的增強以及藥物排出泵的上調(diào),這些特征暗示PTMs可能出現(xiàn)了變化。
1.糖基化
影響藥物靶點:糖基化改變藥物靶點結(jié)構(gòu),降低藥物結(jié)合力,如EGFR的N-糖基化降低藥物結(jié)合力,從而導(dǎo)致耐藥性。
影響藥物外排泵:糖基化改變藥物外排泵活性,使腫瘤細胞更容易將藥物泵出細胞外,如MRP1和MRP4的糖基化增加腫瘤細胞對化療藥物的耐藥性。
影響細胞增殖和凋亡:糖基化抑制細胞凋亡,如O-GlcNAcylation,增加耐藥性。
影響DNA損傷修復(fù):糖基化抑制DNA損傷修復(fù),如MUC1的糖基化抑制DNA損傷修復(fù),增加對順鉑的耐藥性。
圖2 糖基化與抗腫瘤藥物耐藥性(圖源:Miao, et al., Drug Resist Updat, 2024)
2.泛素化
調(diào)節(jié)細胞死亡途徑:泛素化通過影響細胞死亡途徑來調(diào)節(jié)腫瘤細胞的敏感性,細胞凋亡過程中,泛素化可以穩(wěn)定或降解關(guān)鍵蛋白。
調(diào)節(jié)DNA損傷修復(fù):泛素化在DNA損傷修復(fù)過程中扮演重要角色。
調(diào)節(jié)細胞信號通路:泛素化可以影響多種信號通路,如Wnt信號通路、β-連環(huán)蛋白、NOTCH2和PDAC相關(guān)通路,這些通路的異常激活或抑制可能導(dǎo)致腫瘤細胞對特定藥物的耐藥性。
調(diào)節(jié)其他機制:泛素化還涉及蛋白降解、SET蛋白降解、AEBP2泛素化、P27泛素化、Rab35去泛素化、p53泛素化降解等多個方面,這些過程的異常調(diào)控可能導(dǎo)致腫瘤細胞對多種藥物的耐藥性。
圖3 泛素化與抗腫瘤藥物耐藥性(圖源:Miao, et al., Drug Resist Updat, 2024)
3.SUMO化
影響藥物靶點蛋白的穩(wěn)定性:SUMO化可以增強或減弱藥物靶點蛋白的穩(wěn)定性,進而影響藥物的有效結(jié)合和作用。
調(diào)節(jié)藥物靶點蛋白的降解:SUMO化可以影響藥物靶點蛋白的降解途徑,特別是與泛素化降解途徑的相互作用。
影響藥物靶點蛋白的功能:SUMO化可以改變藥物靶點蛋白的活性、結(jié)構(gòu)和定位,從而影響藥物的療效。
影響細胞信號通路:SUMO化可以調(diào)節(jié)細胞信號通路中的關(guān)鍵蛋白,影響藥物的作用。
影響基因表達:SUMO化可以影響基因轉(zhuǎn)錄和表達,進而影響藥物的療效。
4.乙酰化
影響組蛋白乙?;?/span>組蛋白乙酰化可以改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu),影響基因的表達。
影響非組蛋白乙?;?/span>非組蛋白乙?;梢愿淖兊鞍踪|(zhì)的活性、結(jié)構(gòu)和定位。
影響細胞信號通路:乙?;梢杂绊懠毎盘柾分械年P(guān)鍵蛋白。
影響DNA損傷修復(fù):乙酰化可以影響DNA損傷修復(fù)蛋白的功能。
影響腫瘤微環(huán)境(TME):乙酰化可以影響TME中免疫細胞的浸潤和功能。
5.磷酸化
影響藥物靶點蛋白的活性:磷酸化可以激活或抑制藥物靶點蛋白的活性。
影響藥物靶點蛋白的降解:磷酸化可以影響藥物靶點蛋白的降解途徑,例如泛素化降解。
影響藥物靶點蛋白的定位:磷酸化可以改變藥物靶點蛋白的細胞定位。
影響細胞信號通路:磷酸化可以調(diào)節(jié)細胞信號通路中的關(guān)鍵蛋白。
影響細胞周期:磷酸化可以影響細胞周期調(diào)控蛋白的活性,從而影響細胞的增殖和藥物敏感性。
6.棕櫚酰化
影響蛋白質(zhì)的定位和運輸:棕櫚?;梢詫⒌鞍踪|(zhì)錨定在細胞膜上,影響其參與細胞信號傳導(dǎo)和藥物作用。
影響蛋白質(zhì)的功能和活性:棕櫚酰化可以改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。
影響蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性:棕櫚酰化可以增強蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。
影響蛋白質(zhì)與其他分子的相互作用:棕櫚?;梢愿淖兊鞍踪|(zhì)與其他分子的相互作用。
影響細胞代謝:棕櫚酰化可以影響細胞代謝過程。
7.乳酸化
影響細胞代謝和免疫逃逸:乳酸化通過調(diào)節(jié)如H3K18la、H3K9la和H4K12la等關(guān)鍵蛋白的乳酸化水平,影響腫瘤細胞的代謝重編程和免疫逃逸。
促進腫瘤細胞增殖和遷移:乳酸化可以促進如GALNT14和MUC1等蛋白的表達,影響細胞生長和遷移,從而增強腫瘤的發(fā)生/進展和抗腫瘤藥物的耐藥性。
影響TME:乳酸化通過調(diào)節(jié)TME中的免疫細胞浸潤和功能,影響如膀胱癌和膠質(zhì)母細胞瘤等腫瘤對化療藥物的耐藥性。
影響藥物敏感性:乳酸化通過影響關(guān)鍵蛋白的乳酸化水平,如H3K18la、H3K9la和H4K12la,影響腫瘤細胞對特定化療藥物的敏感性。
影響細胞命運:乳酸化通過調(diào)節(jié)如Numb/Parkin等蛋白的表達,影響腫瘤細胞的代謝調(diào)節(jié)和細胞塑性,從而影響細胞命運。
圖4 乳酸化與抗腫瘤藥物耐藥性(圖源:Miao, et al., Drug Resist Updat, 2024)
PTMs在抗微生物藥物耐藥性中的作用
微生物,包括細菌、真菌和病毒,對藥物的抗性是一個全球性的公共衛(wèi)生問題。PTMs在微生物的藥物耐藥性中起著關(guān)鍵作用。例如,細菌的PTMs可以改變藥物靶點的結(jié)構(gòu)和功能,影響藥物的結(jié)合和作用。此外,PTMs還可能參與調(diào)控微生物的代謝途徑,影響藥物的效果。例如,某些PTMs可以改變細菌細胞壁的合成,從而影響抗生素的滲透和作用。因此,PTMs可以作為開發(fā)新型抗微生物藥物的靶點,通過針對特定的PTM,可以開發(fā)出新的藥物或藥物組合,以提高治療效果并克服耐藥性。
圖5 PTMs參與抗微生物藥物耐藥性(圖源:Miao, et al., Drug Resist Updat, 2024)
PTMs在抗病毒藥物耐藥性中的作用
病毒蛋白的PTMs可以影響其活性、結(jié)構(gòu)和定位,從而影響藥物的作用。例如,某些PTMs可以改變病毒蛋白的穩(wěn)定性,影響藥物的結(jié)合和作用。此外,PTMs還可能參與調(diào)控病毒的復(fù)制和組裝過程,影響藥物的效果。例如,某些PTMs可以改變病毒顆粒的組裝和釋放,從而影響抗病毒藥物的作用。因此,PTMs可以作為開發(fā)新型抗病毒藥物的靶點,通過針對特定的PTM,可以開發(fā)出新的藥物或藥物組合,以提高治療效果并克服耐藥性。
圖6 PTMs參與抗病毒藥物耐藥性(圖源:Miao, et al., Drug Resist Updat, 2024)
拜譜小結(jié)
PTMs在藥物抗性研究中的意義不言而喻。它們不僅參與了藥物抗性的形成,還為開發(fā)新的治療方法提供了重要的靶點。未來的研究需要深入探索PTMs在藥物抗性中的具體機制,開發(fā)新的檢測技術(shù)和治療策略,以克服藥物抗性,提高治療效果。
拜譜生物,作為國內(nèi)領(lǐng)先的多組學公司,可提供完善成熟的蛋白組學、代謝組學、修飾組學等多組學產(chǎn)品技術(shù)服務(wù)體系。在修飾組學領(lǐng)域,拜譜生物有半胱氨酸修飾蛋白質(zhì)組學產(chǎn)品,現(xiàn)可提供棕櫚?;?、亞硝基化、谷胱甘肽化、次磺酸化、硫巰基化、Total氧化還原、游離巰基蛋白質(zhì)組學檢測服務(wù)。還有磷酸化、乙?;?、乳酸化、泛素化、SUMO化修飾蛋白質(zhì)組等修飾組學作為我司特色修飾產(chǎn)品,采用高效的富集技術(shù)、尖端的Astral儀器可實現(xiàn)修飾蛋白和位點的高質(zhì)量檢出。歡迎大家咨詢!
參考文獻:
Miao C, Huang Y, Zhang C, Wang X, Wang B, Zhou X, Song Y, Wu P, Chen ZS, Feng Y. Post-translational modifications in drug resistance. Drug Resist Updat. 2024 Nov 21;78:101173. doi:10.1016/j.drup.2024.101173.