非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)是導(dǎo)致癌癥相關(guān)死亡的最常見原因,在NSCLC的各種病理類型中,肺腺癌(LUAD)已成為主要的類型,盡管LUAD治療不斷取得進(jìn)展,但療效仍然微乎其微。因此,確定一個(gè)明確的LUAD診斷和預(yù)后評(píng)估的生物學(xué)標(biāo)志物是至關(guān)重要的。
2024年10月1日,蘇北人民醫(yī)院在Cancer Letters(IF=9.1)上發(fā)表題為“6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells”的研究文章。本文研究表明,PGD在LUAD中上調(diào),并抑制AMPK通路,從而增強(qiáng)糖酵解和脂肪酸合成,促進(jìn)腫瘤的惡性進(jìn)展。因此,靶向PGD是治療LUAD的一種潛在的治療策略。該研究成果中拜譜生物為其提供蛋白互作組的檢測(cè)與分析。
文章名稱:6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells(Cancer Letters,IF=9.1,2024.10)
客戶單位:蘇北人民醫(yī)院
研究材料:IP beads
拜譜提供技術(shù):蛋白互作組分析
技術(shù)路線:
研究結(jié)果
磷酸戊糖途徑(PPP)在LUAD中被顯著激活
從6例LUAD患者中收集了1份正常組織樣本和12份腫瘤組織樣本進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序,注釋有T細(xì)胞、髓系細(xì)胞、上皮細(xì)胞、B細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和肥大細(xì)胞(圖1A-C),其中上皮細(xì)胞,分為15個(gè)簇,根據(jù)CNV(拷貝數(shù)變異)將其分為正常類別和腫瘤類別(圖1D-F)。在惡性上皮細(xì)胞亞群內(nèi),PPP中的基因顯著上調(diào)(圖1G),且在上皮細(xì)胞從良性狀態(tài)向惡性狀態(tài)轉(zhuǎn)變的過程中,PPP中限速酶(PGD、G6PD、TALDO1和TKT)的表達(dá)水平逐漸升高(圖1H-I)。這些發(fā)現(xiàn)表明,PPP在LUAD的腫瘤發(fā)生和發(fā)展中起著關(guān)鍵作用。
圖1 磷酸戊糖途徑(PPP)在LUAD中被顯著激活
(圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
PGD在LUAD中高表達(dá),并與不良預(yù)后相關(guān)
分析568例LUAD患者和545例LUSC患者的TCGA數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)PPP在LUSC和LUAD樣本中顯著富集(圖2A-B),且四種限速酶(PGD、G6PD、TALDO1和TKT)的表達(dá)均顯著升高(圖2C),在LUAD患者中,PGD的高表達(dá)與不良預(yù)后相關(guān)。
構(gòu)建組織芯片(TMA)對(duì)PGD進(jìn)行染色,證實(shí):在LUAD和LUSC患者的癌變組織中,PGD的表達(dá)量高于配對(duì)的正常組織。小鼠原位LUAD模型腫瘤和鄰近正常組織IHC結(jié)果進(jìn)一步證明,揭示PGD可能作為L(zhǎng)UAD的致癌基因,加速LUAD的進(jìn)展(圖2I)。
圖2 PGD在LUAD中高表達(dá),并與不良預(yù)后相關(guān)
圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
PGD促進(jìn)LUAD細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲
LUAD細(xì)胞中PGD的蛋白水平高于人正常肺支氣管上皮細(xì)胞。構(gòu)建敲除和過表達(dá)PGD細(xì)胞系,CCK-8證明PGD促進(jìn)LUAD細(xì)胞增殖(圖A-D),體外遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)證明PGD促進(jìn)LUAD細(xì)胞轉(zhuǎn)移(圖3F-G);
PGD抑制劑處理LUAD細(xì)胞,細(xì)胞活力劑量依賴性下降(圖3H),且抑制其集落形成(圖3I),降低其遷移和侵襲能力(圖3K-L)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中也證實(shí),敲除PGD顯著抑制腫瘤生長(zhǎng)(圖3M-P)。
圖3 PGD促進(jìn)LUAD細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲
(圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
抑制PGD可降低酶活性,抑制糖酵解和脂肪酸合成
PGD敲除或抑制劑處理,降低細(xì)胞NADPH/NADP+比值(圖4D),增加ROS水平(圖4A-C)。KEGG發(fā)現(xiàn)PGD-high細(xì)胞在脂肪細(xì)胞因子信號(hào)通路和糖酵解通路中顯著富集(圖4E)。且敲除PGD顯著抑制了乳酸的產(chǎn)生,降低糖酵解能力(圖4F-G),Oil Red O染色顯示,PGD顯著促進(jìn)了細(xì)胞的脂質(zhì)積累(圖4H)。這些發(fā)現(xiàn)提示PGD可能促進(jìn)糖酵解和脂質(zhì)代謝來驅(qū)動(dòng)LUAD的進(jìn)展。
圖4 抑制PGD可降低酶活性,抑制糖酵解和脂肪酸合成
(圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
PGD通過與IQGAP1競(jìng)爭(zhēng)性地相互作用來抑制AMPK通路的激活
抑制PGD,LUAD細(xì)胞中的p-AMPK水平顯著升高(圖5A),利用蛋白互作組檢測(cè)PGD互作蛋白(圖5B-C),從中篩選出可以調(diào)控AMPK通路的關(guān)鍵蛋白IQGAP1(圖5D),co-IP、免疫熒光染色證實(shí)了PGD與IQGAP1相互作用(圖5E-G)。且發(fā)現(xiàn)PGD通過與IQGAP1其IQ域競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,阻止其與AMPKα結(jié)合而抑制AMPK磷酸化(圖5H-J)。
圖5 PGD通過與IQGAP1競(jìng)爭(zhēng)性地相互作用來抑制AMPK通路的激活
(圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
抑制AMPK通路可以恢復(fù)PGD敲除誘導(dǎo)的抗癌作用
敲除PGD能抑制LUAD細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,這種作用能被AMPK抑制劑逆轉(zhuǎn)(圖6A-D),而且敲除PGD所抑制糖酵解和脂肪酸合成,同樣能被AMPK抑制劑逆轉(zhuǎn)(圖6E-H)。
圖6 抑制AMPK通路可以恢復(fù)PGD敲除誘導(dǎo)的抗癌作用
(圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
PGD具有作為一種新的、有效的LUAD治療靶點(diǎn)的潛力
PGD特異性抑制劑與二甲雙胍聯(lián)合使用對(duì)體外腫瘤生長(zhǎng)有協(xié)同抑制作用(圖7B),且在腫瘤異種移植研究中得到證實(shí)(圖7C-E)。另外該組合表現(xiàn)出最顯著的AMPK通路激活(圖7F),綜上所述,PGD及其下游AMPK通路是治療LUAD的潛在新靶點(diǎn)。
圖7 PGD具有作為一種新的、有效的LUAD治療靶點(diǎn)的潛力
(圖源:Jun Wu., et al., Cancer Lett., 2024)
文章小結(jié)
異常代謝已成為癌癥的一個(gè)顯著特征,在肺腺癌(LUAD)的發(fā)生和發(fā)展中起著關(guān)鍵作用。在這項(xiàng)研究中,單細(xì)胞測(cè)序揭示,在惡性上皮細(xì)胞亞群的惡性進(jìn)展過程中,代謝酶6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶(PGD)顯著上調(diào);體外和體內(nèi)分析發(fā)現(xiàn),PGD敲除或抑制其活性可抑制LUAD細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲;TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析和LUAD組織芯片數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)PGD上升,并且與LUAD患者的不良預(yù)后密切相關(guān),可作為潛在治療靶點(diǎn)。
拜譜小結(jié)
研究首次揭示肺腺癌中IQGAP1是PGD的強(qiáng)有力的新型相互作用蛋白。PGD通過與已知的AMPKα結(jié)合伴侶IQGAP1的IQ域競(jìng)爭(zhēng)性相互作用,降低了p-AMPK的水平,從而促進(jìn)了LUAD細(xì)胞的糖酵解和脂肪酸合成。該研究成果中拜譜生物為其提供蛋白互作組的檢測(cè)與分析。拜譜生物已研發(fā)完成并建立了完善成熟的轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)以及多組學(xué)聯(lián)合產(chǎn)品技術(shù)服務(wù)體系,歡迎致電咨詢!
參考文獻(xiàn):
Wu J, Chen Y, Zou H, Xu K, Hou J, Wang M, Tian S, Gao M, Ren Q, Sun C, Lu S, Wang Q, Shu Y, Wang S, Wang X. 6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells. Cancer Lett. 2024 Oct 1;601:217177. doi: 10.1016/j.canlet.2024.217177