基于質譜的蛋白質組學工作流程通常包括多個步驟,包括細胞裂解、蛋白提取、消化和脫鹽,不同的步驟帶來了一些挑戰(zhàn),包括潛在的樣品污染和損失,重復性等問題,阻礙了微量樣本的質譜檢測。盡管已經開發(fā)了多種針對微量樣本的前處理流程,如SISPROT、SP3等,但是這種方法對極微量樣本的蛋白檢出量有限。
基于此,拜譜生物全新推出了極微量蛋白質組學,采用一步樣品制備法,實現(xiàn)“0”損耗,結合最新的Astral質譜儀突破至數(shù)個細胞的檢測限度,100個細胞可穩(wěn)定鑒定出6000+蛋白,實現(xiàn)蛋白的高質量檢出,挖掘特殊樣本的重要信息,助力疾病機制解析,推動生物醫(yī)藥的發(fā)展。
圖1極微量蛋白質組技術路線
產品特色
流程一體化,實現(xiàn)“0”損耗
極微量蛋白質組通過一步樣本制備法實現(xiàn)細胞的裂解、酶解、脫鹽一體化,在1管中完成了制備的所有流程,避免了樣本轉移造成的損失,達到幾乎0損耗。為流式分選的細胞、原代培養(yǎng)的細胞、臨床穿刺組織、房水等特殊樣本提供了解決辦法,提高了樣本鑒定深度和準確性,為極微量樣本的研究提供了重要的工具。
圖2極微量蛋白質組流程一體化
更高鑒定量、更高穩(wěn)定性、更高準確性
極微量蛋白質組學的實測數(shù)據如圖所示,基于Astral對細胞樣本測試,在100個細胞中實現(xiàn)了6600+的蛋白檢出,在1000個細胞中突破至8500+的蛋白檢出,實現(xiàn)了低樣本量,高檢出量,打開了極微量世界的大門。同時,進一步的相關性分析表明樣本間具有較高的相關性,數(shù)據質量較高。
圖3極微量蛋白質組實測數(shù)據
世界一流質譜儀,高級豐富生信分析
拜譜生物購入了世界一流的Orbitrap Astral質譜儀,大大提高了數(shù)據的檢出質量,實現(xiàn)了更高通量、更深覆蓋、更高靈敏度、更精準定量和更高穩(wěn)定性與重現(xiàn)性。同時拜譜生物能夠為客戶提供全流程服務,包括方案設計、技術指導、高級豐富的生信分析服務等。
圖4一流質譜儀和豐富的生信分析
應用場景
01.細胞樣本
細胞是構成生物體的基本單位,也是生物學研究的核心內容之一。通過組學的手段深入研究細胞可以幫助我們了解生物體的組織結構、功能和生命活動的本質,進而對疾病的病因和治療提供指導。但對于一些特殊的細胞樣本類型,比如流式分選的細胞、原代培養(yǎng)的細胞等,這些樣本類型珍貴、不易獲取,往往達不到常規(guī)蛋白質組學對于樣本量的要求,而拜譜生物全新推出的極微量蛋白質組學可以輕松解決這一問題。
圖5特殊的細胞樣本
02.穿刺樣本
穿刺樣本是通過細針或刺激物穿透皮膚和軟組織,對腫瘤進行針吸或者切割,獲得的微小組織成分或細胞。穿刺樣本具有取材量較少,取樣難度高等特點,因此研究方法有限。拜譜全新推出的極微量蛋白質組作為一種針對此類樣本的組學技術,通過檢測穿刺活檢采集的樣本可以對組織、細胞的相關特征等信息進行分析,對疾病的診斷和治療具有重要的作用。
圖6穿刺樣本
送樣建議
拜譜小結
極微量蛋白質組學介于微量蛋白質組學和單細胞蛋白質組學之間,對于一些特殊的樣本類型,比如流式分選的細胞、原代培養(yǎng)細胞,以及一些臨床穿刺組織、玻璃體、房水等能夠實現(xiàn)低樣本、高質量的數(shù)據檢出,細胞用量低至數(shù)個,由此拜譜生物建立了常規(guī)蛋白質組學、微量蛋白質組學、極微量蛋白質組學、單細胞蛋白質組學全方面、豐富的蛋白質組學平臺,滿足大家不同的研究需求,提供全數(shù)量級別的蛋白質組學檢測,助力挖掘醫(yī)學樣本的重要信息,歡迎大家咨詢!