脂質(zhì)作為植物體內(nèi)的一類重要化合物,不僅構(gòu)成了細胞膜的基本骨架,還參與了能量儲存、信號傳導、細胞通訊、物質(zhì)運輸?shù)榷喾N生物學過程。脂質(zhì)組學作為系統(tǒng)研究植物體內(nèi)所有脂質(zhì)分子的特性及其生物學功能的學科,為我們提供了全面理解植物脂質(zhì)代謝及其調(diào)控機制的工具。植物有成千上萬種脂質(zhì)分子,根據(jù)它們的結(jié)構(gòu)和化學性質(zhì)可以分為脂肪酸(Fatty acid)、甘油酯(Glycerolipids)、甘油磷脂(Glycerol-phospholipids)、鞘脂(Sphingolipids)和甾醇(Sterols)。
葉綠體是綠色植物進行光合作用的主要場所,其中類囊體是葉綠體中的一種單層膜囊狀結(jié)構(gòu),類囊體的存在增大了葉綠體的膜面積,從而增大了受光面積。植物類囊體膜上分布著多種色素蛋白復合物和脂質(zhì),但脂質(zhì)成分中大約一半是糖脂質(zhì),主要包括雙半乳糖甘油二酯(DGDG)、硫代異鼠李糖甘油二酯(SQDG) 和單半乳糖甘油二酯(MGDG)。這些膜脂對植物光合作用和生長發(fā)育至關重要,深入了解植物類囊體膜中主要脂質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能及其生物合成,有助于闡明光合作用光能及物質(zhì)轉(zhuǎn)化的調(diào)控機理。
拜譜生物全新推出PLT5500植物高通量靶向脂質(zhì)組產(chǎn)品,多針檢測5500+脂質(zhì)分子,其中植物類囊體膜上主要糖脂質(zhì)1000+,提供絕對定量數(shù)據(jù)和豐富的數(shù)據(jù)分析內(nèi)容,為一線科研工作者探究脂質(zhì)在植物研究中的重要作用提供支持。歡迎大家咨詢!
植物靶向脂質(zhì)自建數(shù)據(jù)庫:5500+
技術優(yōu)勢
項目流程
項目經(jīng)驗(部分)
應用方向
一、案例分析
脂質(zhì)與非生物脅迫
文章題目:Mechanisms of Spirodela polyrhiza tolerance to FGD wastewater-induced heavy-metal stress: Lipidomics, transcriptomics, and functional validation
發(fā)表雜志:Journal of Hazardous Materials IF:12.2 2024
與陸生被子植物不同,淡水水生被子植物浮萍(Spirodela polyrhiza)直接生長在水中,對重金屬脅迫有明顯的反應。植物在重金屬脅迫下積累代謝物,包括脂質(zhì)和碳水化合物,但它們?nèi)绾纹胶獯x物水平尚不清楚,介導重金屬脅迫反應的基因網(wǎng)絡仍不清楚。本研究表明,煙氣脫硫(FGD)廢水誘導的重金屬脅迫降低綠素含量,抑制了生長,減少了膜脂的生物合成,并刺激了膜脂的降解,導致甘油三酯和碳水化合物的積累。在FGD廢水處理裝置中,單半乳糖二?;视?/span>的降解產(chǎn)物主要是多不飽和脂肪酸(18:3),被摻入三?;视椭小⑴c早期脂肪酸生物合成、β-氧化和脂質(zhì)降解的基因上調(diào),而參與角質(zhì)層蠟質(zhì)生物合成的基因下調(diào)。轉(zhuǎn)錄因子基因WRINKLED3 (SpWRI3)在FGD廢水處理植株中表達上調(diào),其異位表達增加了轉(zhuǎn)基因擬南芥對FGD廢水的耐受性。轉(zhuǎn)基因擬南芥在脅迫下谷胱甘肽含量增加,丙二醛含量降低,表明SpWRI3基因參與了浮萍對FGD廢水重金屬脅迫的耐受。這些結(jié)果為提高植物對重金屬脅迫的耐受性提供了基礎。
圖1 文章技術路線
(圖源:Muthan, Bagyalakshmi et al., J Hazard Mater. 2024)
圖2 (A)煙氣脫硫廢水重金屬脅迫降解單半乳糖基二?;视?MGDG)和雙半乳糖基二酰基甘油(DGDG),并隨后將18:3游離脂肪酸摻入TAG的示意圖。(B)淀粉降解、碳循環(huán)和淀粉粒度增加的示意圖。
(圖源:Muthan, Bagyalakshmi et al., J Hazard Mater. 2024)
脂質(zhì)與生長發(fā)育
文章題目:LIPID TRANSFER PROTEIN4 regulates cotton ceramide content and activates fiber cell elongation
發(fā)表雜志:PLANT PHYSIOLOGY IF:7.4 2023
細胞伸長是植物生長發(fā)育的基本過程。研究表明,脂質(zhì)代謝在細胞伸長中起重要作用;然而,相關的功能機制仍然是未知的。在這里,文章報道了棉花(Gossypium hirsutum)脂質(zhì)轉(zhuǎn)移蛋白4 (GhLTP4)通過提高神經(jīng)酰胺(Cers)含量和激活生長素反應途徑來促進纖維細胞伸長。此外,生長素含量和吲哚-3-乙酸(IAA)反應基因的轉(zhuǎn)錄水平在GhLTP4過表達的棉纖維中顯著增加。Cers的外源施用促進了纖維伸長,而NPA(N-1-萘二酸,一種極性生長素運輸抑制劑)抵消了這種促進作用,表明IAA在Cers的下游發(fā)揮調(diào)節(jié)纖維伸長的功能。研究結(jié)果為脂質(zhì)和生長素信號通路之間的復雜相互作用提供了見解,以促進植物細胞伸長。
圖3 WT和GhLTP4轉(zhuǎn)基因品系10-dpa纖維的脂肪酸和脂質(zhì)分析
(圖源:Duan, Yujia et al. , Plant Physiol. 2023)
圖4 GhLTP4調(diào)控棉纖維細胞伸長的模式圖
(圖源:Duan, Yujia et al. , Plant Physiol. 2023)
脂質(zhì)與植物營養(yǎng)
文章題目:Shotgun lipidomics reveals the changes in phospholipids of brown rice during accelerated aging
發(fā)表雜志:FOOD RESEARCH INTERNATIONAL IF:8.1 2023
糙米具有較高的營養(yǎng)價值,越來越受到人們的關注;然而,糙米在老化過程中磷脂分子種類的變化卻知之甚少。本研究采用脂質(zhì)組學研究了4個糙米品種(2個粳稻品種和2個秈稻品種)在加速老化過程中磷脂分子種類的變化。共鑒定出64種磷脂分子種類,其中大多數(shù)富含多不飽和脂肪酸。對于粳稻,磷脂酰膽堿(PC)、磷脂酰乙醇胺(PE)和磷脂酰甘油(PG)在加速老化過程中逐漸減少。然而,在加速老化過程中,秈米中的PC、PE和PG含量沒有表現(xiàn)出差異。
在加速老化過程中,從四種糙米中篩選出顯著不同的磷脂分子種類。基于這些顯著不同的磷脂,描述了加速老化過程中包括甘油磷脂代謝和亞油酸代謝在內(nèi)的代謝途徑。本研究結(jié)果有助于解釋加速老化對糙米磷脂的影響,并有助于理解磷脂降解與糙米劣變之間的關系。
圖5 磷脂分子種類的柱狀圖及熱圖
(圖源:Huang, Shanshan et al. ,Food Res Int. 2023)
圖6 脂質(zhì)組學數(shù)據(jù)多元統(tǒng)計分析及通路富集分析
(圖源:Huang, Shanshan et al. ,Food Res Int. 2023)
二、拜譜小結(jié)
脂質(zhì)是生命有機體中一類難溶于水而易溶于氯仿、醇、醚等非極性有機溶劑的重要化合物,可以參與并調(diào)節(jié)多種生命活動,并且在植物應答非生物脅迫 (鹽脅迫、干旱脅迫和溫度脅迫等) 過程中發(fā)揮著重要生理功能。但長期以來,對于脂質(zhì)的研究多集中于動物細胞和醫(yī)學領域,卻疏于關注植物研究領域。拜譜生物隆重推出PLT5500植物高通量靶向脂質(zhì)組產(chǎn)品,結(jié)合組學技術,在多個層面對脂質(zhì)應答逆境脅迫的分子調(diào)控網(wǎng)絡進行研究,從而更加全面系統(tǒng)地揭示植物脂質(zhì)應答逆境脅迫機理。拜譜生物作為國內(nèi)領先的多組學公司,可提供完善成熟的蛋白組學、代謝組學、轉(zhuǎn)錄組學等多組學產(chǎn)品技術服務體系。敬請咨詢!
參考文獻
1.Muthan B,Wang J,Welti R, et al. Mechanisms of Spirodela polyrhiza tolerance to FGD wastewater-induced heavy-metal stress: Lipidomics, transcriptomics, and functional validation. J Hazard Mater. 2024;469:133951. doi:10.1016/j.jhazmat.2024.133951
2.Duan Y,Shang X,He Q, et al. LIPID TRANSFER PROTEIN4 regulates cotton ceramide content and activates fiber cell elongation. Plant Physiol. 2023;193 (3):1816-1833. doi:10.1093/plphys/kiad431
3.Huang S,Zhang D,Wang Q, et al. Shotgun lipidomics reveals the changes in phospholipids of brown rice during accelerated aging. Food Res Int. 2023;171:113073. doi:10.1016/j.foodres.2023.113073