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新品發(fā)布,拜譜生物乳酸化修飾蛋白質(zhì)組學,“乳”期而至,突破萬級位點!

發(fā)布時間:2024-07-30

長期以來,乳酸一直被認為是糖酵解代謝的“廢物”。然而,2017年,Cell發(fā)表重大突破,證明乳酸給生長中的腫瘤提供燃料。這項新的發(fā)現(xiàn)推翻了葡萄糖是燃料,乳酸是廢物的傳統(tǒng)腫瘤代謝觀點,它挑戰(zhàn)了存在將近一個世紀的“瓦爾堡效應(yīng)(Warburg effect)”。同年,Nature也為乳酸正名,發(fā)現(xiàn)大多數(shù)組織和腫瘤中的主要TCA碳源是循環(huán)乳酸(circulating lactate)而不是葡萄糖。這些發(fā)現(xiàn)為研究癌癥的靶向代謝療法開辟了一條新的途徑,乳酸這一代謝調(diào)控領(lǐng)域逐漸被了解。

在細胞代謝過程中,乳酸的積累促進組蛋白賴氨酸殘基發(fā)生乳酸化修飾。研究證實,乳酸化是乳酸功能的重要組成部 A分,參與腫瘤增殖、神經(jīng)興奮、炎癥等生物過程。拜譜生物現(xiàn)推出乳酸化修飾蛋白組,特異性富集乳酸化肽段,結(jié)合最新Orbitrap Astral質(zhì)譜儀實現(xiàn)乳酸化表達水平的高質(zhì)量檢出,乳酸化修飾位點突破1w+,為乳酸在代謝疾病、表觀遺傳和Crosstalk等調(diào)控研究指引了新方向。

圖1 乳酸化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)路線

PART1· 產(chǎn)品特色 ·

特色1:嚴格高質(zhì)量數(shù)據(jù)檢出,實測位點數(shù)突破1w+

拜譜生物全新推出了乳酸化修飾蛋白質(zhì)組學產(chǎn)品,達到了萬級位點檢測深度,開辟了蛋白質(zhì)研究的新領(lǐng)域。通過特異性富集、質(zhì)譜檢測和權(quán)威Swissprot數(shù)據(jù)庫檢索實現(xiàn)了嚴格高質(zhì)量數(shù)據(jù)檢出。多個實測項目數(shù)據(jù)表明,乳酸化修飾組產(chǎn)品在人源細胞中平均檢出5k+乳酸化蛋白位點檢出量超越10k+。拜譜生物乳酸化修飾組的卓越表現(xiàn)為相關(guān)疾病研究帶來了無限可能。

圖2 乳酸化修飾組實測數(shù)據(jù)

特色2:國自然超級熱點,PTM新熱潮

自發(fā)現(xiàn)以來,乳酸化修飾的相關(guān)文章陸續(xù)登上Nature、Cell等頂級期刊。越來越多的機制研究發(fā)現(xiàn)乳酸化修飾在腫瘤的發(fā)生發(fā)展、心腦血管疾病、免疫細胞激活等過程中發(fā)揮重要作用,這些研究對于深入認識疾病過程和未來臨床應(yīng)用具有深遠意義。因此,乳酸化修飾成為近幾年國自然基金申請的熱點方向之一。2023年,乳酸化的中標數(shù)達到129個,逐年呈現(xiàn)上升趨勢。綜上所述,乳酸化修飾蛋白組研究將在未來幾年中掀起一場新的研究熱潮。

圖3 乳酸化國自然中標數(shù)

特色3:國際尖端Astral質(zhì)譜儀,更高、更深、更精準

2023年,拜譜生物首批購入了Orbitrap Astral質(zhì)譜儀,對乳酸化修飾蛋白質(zhì)組檢測的全流程進行了優(yōu)化,大大提高了數(shù)據(jù)的檢出質(zhì)量,實現(xiàn)了更高通量、更深覆蓋、更高靈敏度、更精準定量和更高穩(wěn)定性與重現(xiàn)性。

圖4國際頂尖Astral質(zhì)譜儀

特色4:豐富生信分析內(nèi)容,專業(yè)技術(shù)團隊指導

拜譜生物擁有一支技術(shù)精湛、經(jīng)驗豐富的團隊,能夠為客戶提供全流程服務(wù),包括方案設(shè)計、技術(shù)指導、豐富的生信分析服務(wù)等。除此之外,團隊成員也在積極拓展新的分析技術(shù)和方法,不斷更新和優(yōu)化我們的分析流程,為客戶提供更好的服務(wù)體驗。

圖5豐富的生信分析內(nèi)容

PART2· 應(yīng)用方向 ·

應(yīng)用方向一:

代謝相關(guān)疾?。[瘤、神經(jīng)、心血管、免疫等)

乳酸是糖酵解的最終產(chǎn)物,是線粒體呼吸的關(guān)鍵能量來源,還是葡萄糖生成的前體和信號分析。在細胞內(nèi),一方面,乳酸可通過TCA循環(huán)和糖異生進行分解代謝,另一方面,乳酸可轉(zhuǎn)化為乳酰輔酶A,參與組蛋白和非組蛋白的乳酸化。

研究表明,腫瘤組織中的乳酸化促進腫瘤免疫逃逸,并可直接調(diào)控癌基因表達,促進腫瘤生長、轉(zhuǎn)移和侵襲。乳酸化還調(diào)節(jié)巨噬細胞的基因表達,作為免疫抑制引起的炎癥、癌癥和全身性疾病的治療靶點具有巨大的潛力。此外,乳酸化是神經(jīng)元的能量底物來源和大腦中有價值的細胞間信號分子,與神經(jīng)和精神疾病有關(guān),乳酸誘導的乳酸化還可能有助于DNA修復、胚胎植入和脂肪肝的改善,為多種疾病提供新的診斷和治療策略。

圖6 乳酸會導致多種疾病(圖源:Li X, et al., Signal Transduct Target Ther,

應(yīng)用方向二:

乳酸化+乙?;?其他翻譯后修飾Crosstalk

細胞代謝會產(chǎn)生多種代謝物,如乙酰輔酶A、NAD+、SAM、α-KG、ATP和琥珀酸,它們之間具有復雜的相互作用關(guān)系,并作為底物或輔因子修飾染色質(zhì)和蛋白質(zhì),發(fā)生乳酸化、乙酰化、甲基化、磷酸化、琥珀?;-GlcNAc糖基化等。蛋白質(zhì)的不同PTM之間的聯(lián)系是普遍存在的。例如,乳酸化與乙酰化之間存在交叉串擾(Crosstalk)。乳酸可促進組蛋白乙酰化并作為HDAC(組蛋白去乙?;福┮种苿┱{(diào)節(jié)基因表達,而HDAC發(fā)揮去乳酸化活性。因此,乳酸化+乙?;?其他翻譯后修飾可全面完整地探究蛋白功能,同時創(chuàng)新研究也存在無限可能。

圖7 有關(guān)表觀遺傳重塑的不同修飾間的代謝聯(lián)系(圖源:Sun L, et al., Protein Cell, 2022)

PART3

· 送樣建議 ·

PART4

·拜譜小結(jié) ·

乳酸是糖酵解的最終產(chǎn)物,是線粒體呼吸的關(guān)鍵能量來源,還是葡萄糖生成的前體和信號分析。研究表明,乳酸化修飾是乳酸發(fā)揮功能的重要方式,參與糖酵解相關(guān)細胞功能、巨噬細胞極化、血管功能、線粒體、神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)控等重要生命活動,可為腫瘤、心血管、發(fā)育、神經(jīng)等領(lǐng)域的研究指引新方向。拜譜生物全新推出了乳酸化修飾蛋白質(zhì)組學,特異性富集乳酸化肽段,結(jié)合最新Orbitrap Astral質(zhì)譜儀實現(xiàn)了萬級乳酸化位點的檢出,助力疾病相關(guān)機制解析,歡迎大家致電咨詢!

參考文獻

[1] Li X, Yu T. Lactate metabolism in human health and disease. Signal Transduct Target Ther. 2022 Sep 1;7(1):305. doi: 10.1038/s41392-022-01151-3.

[2] Sun L, Gao P. Metabolic reprogramming and epigenetic modifications on the path to cancer. Protein Cell. 2022 Dec;13(12):877-919. doi: 10.1007/s13238-021-00846-7.

[3] Lv X, Lv Y, Dai X. Lactate, histone lactylation and cancer hallmarks. Expert Rev Mol Med. 2023 Jan;25:e7. doi: 10.1017/erm.2022.42.

[4] Liu X, Zhang Y, Li W, et al. Lactylation, an emerging hallmark of metabolic reprogramming: Current progress and open challenges. Front Cell Dev Biol. 2022 Aug;10:972020. doi: 10.3389/fcell.2022.972020.

[5] Gong H, Zhong H, Cheng L, et al. Post-translational protein lactylation modification in health and diseases: a double-edged sword. J Transl Med. 2024 Jan;22(1):41. doi: 10.1186/s12967-023-04842-9.