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Microbiome(IF=13.8)|拜譜生物多組學(xué)技術(shù)揭示高尿酸血癥引起的腸道菌群失調(diào)在腎損傷中的作用和潛在機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2024-07-19
高尿酸血癥(HUA)是一種以尿酸水平升高為特征的代謝性疾病,其患病率呈上升趨勢(shì),通常與腎損傷有關(guān)。腸道微生物群和腸道來源的尿毒癥毒素是腸-腎軸中的關(guān)鍵介質(zhì),可導(dǎo)致腎功能損害。腸道菌群失調(diào)與多種腎臟疾病有關(guān)。然而,HUA誘導(dǎo)的腸道菌群失調(diào)在腎損傷發(fā)展中的具體作用和潛在機(jī)制尚不清楚。
2024年6月南方醫(yī)科大學(xué)趙曉山團(tuán)隊(duì)在Microbiome(IF13.8)雜志上發(fā)表題為“Gut microbiota dysbiosis in hyperuricaemia promotes renal injury through the activation of NLRP3 inflammasome”文章。研究結(jié)果表明HUA誘導(dǎo)的腸道菌群失調(diào)有助于腎損傷的發(fā)展,可能是通過促進(jìn)腸源性尿毒癥毒素的產(chǎn)生并隨后激活NLRP3炎癥小體。拜譜生物為該研究提供了MT1000醫(yī)學(xué)全靶代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)。


英文標(biāo)題:Gut microbiota dysbiosis in hyperuricaemia promotes renal injury through the activation of NLRP3 inflammasome
中文標(biāo)題:高尿酸血癥中腸道菌群失調(diào)通過激活NLRP3炎癥小體促進(jìn)腎損傷
期刊:Microbiome
2024年影響因子:13.8
發(fā)表時(shí)間:2024年6月
客戶單位:南方醫(yī)科大學(xué)
研究材料:大鼠腎臟組織
拜譜提供技術(shù):MT1000醫(yī)學(xué)全靶代謝組學(xué)檢測(cè)
研究思路:




研究結(jié)果
HUA導(dǎo)致腸道菌群失調(diào)和腸道屏障功能受損
作者通過敲除尿酸酶(UOX)建立HUA大鼠模型。HUA大鼠表現(xiàn)出明顯的腎功能障礙、腎小管損傷、纖維化、NLRP3炎癥小體激活和腸屏障功能受損。為了研究HUA對(duì)腸道微生物群的影響,作者對(duì)UOX?/?同窩大鼠和WT同窩對(duì)照大鼠的糞便進(jìn)行了16S rRNA測(cè)序,以揭示組間腸道微生物群落特征的差異。
PCoA分析顯示了組間微生物群落的相對(duì)分離(圖1A)。在門水平上,WT和UOX?/?大鼠的腸道微生物群主要由厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(actiobacteriota)和變形菌門(Proteobacteria)組成(圖1B)。與WT大鼠相比,UOX?/?大鼠的變形菌群顯著增加,而厚壁菌門減少(圖1C和D)。使用LEfSe分析,在屬水平上鑒定組間差異豐富的糞便細(xì)菌分類群(圖1E)。LEfSe分析結(jié)果顯示,在UOX?/?大鼠中富集了包括大腸桿菌在內(nèi)的6個(gè)細(xì)菌屬,而在WT大鼠中富集了另外兩個(gè)類群(圖1G-N)。
此外,使用KEGG注釋和功能富集,鑒定出了UOX?/?和WT大鼠之間表現(xiàn)出不同富集水平的25個(gè)功能類別(圖1O)。值得注意的是,與腸源性尿毒癥毒素相關(guān)的功能,包括色氨酸和苯丙氨酸代謝,在UOX?/?大鼠中增加。此外,KEGG通路分析還顯示,受HUA干擾的微生物群與細(xì)菌侵襲上皮細(xì)胞增加和丁酸鹽代謝減少有關(guān)。并評(píng)估了HUA引起的腸道微生物群紊亂對(duì)腸道屏障功能的影響(圖1P-T)。綜上所述,這些結(jié)果表明UOX?/?大鼠的HUA促進(jìn)腸道微生物群失調(diào)和腸道屏障功能受損。


圖1. HUA導(dǎo)致UOX?/?大鼠腸道微生物群失調(diào)和腸道屏障功能受損

(圖源:Zhou, Xinghong et al., Microbiome. 2024)



HUA大鼠腎臟中腸道源性尿毒癥毒素顯著增加
腸源代謝物可能是腸-腎軸的重要介質(zhì),因此在腎臟健康中起重要作用。腸道微生物組的KEGG功能預(yù)測(cè)分析結(jié)果表明,HUA誘導(dǎo)的腸道菌群失調(diào)增加了腸道源性尿毒癥毒素的產(chǎn)生。因此,作者使用廣泛靶向代謝組學(xué)分析來比較UOX?/?和WT大鼠的腎臟代謝組學(xué)特征。OPLS-DA模型結(jié)果顯示W(wǎng)T和UOX?/?大鼠之間存在明顯的分離(圖2A)。在VIP > 1和p < 0.05的篩選情況下,WT和UOX?/?組之間共鑒定出266個(gè)差異代謝物。其中,與WT組相比,UOX?/?大鼠的180個(gè)代謝物上調(diào),86個(gè)代謝物下調(diào)。
物質(zhì)分類結(jié)果顯示,這些代謝物主要屬于氨基酸、肽及其類似物、核苷、核苷酸及其類似物、有機(jī)酸及其衍生物、鞘脂、糖及其衍生物、吲哚和雜環(huán)化合物等(圖2B)。在改變的代謝物中,幾種尿毒癥毒素,包括硫酸吲哚酚(IS)、對(duì)甲酚(PC)、馬尿酸(HA)、苯乙酰谷氨酰胺(PAGln)、苯乙酰甘氨酸(PAGly)、犬尿喹啉酸(KA)、L-犬尿氨酸(KYN)、喹啉酸(QA)和甲基胍(MG),在UOX?/?大鼠中上調(diào)(圖2D)。已知這些毒素中的大多數(shù)來源于腸道微生物群對(duì)包括色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸在內(nèi)的膳食芳香化合物的代謝。
使用KEGG途徑進(jìn)一步分析差異的代謝物(圖2C)。與腸道微生物組一致,差異代謝物的KEGG通路分析顯示,UOX?/?大鼠的色氨酸代謝上調(diào)。此外,UOX?/?大鼠的氨基酸生物合成、嘌呤代謝、丙酮酸代謝、半胱氨酸和蛋氨酸代謝、TCA循環(huán)和cAMP信號(hào)傳導(dǎo)也上調(diào),而維生素消化和吸收、硫胺素代謝和嘧啶代謝下調(diào)。進(jìn)一步進(jìn)行Pearson相關(guān)性分析,了解差異菌群與代謝物之間的關(guān)系(圖2E)。
此外,代謝物與腎功能參數(shù)的相關(guān)性分析顯示,這些腸道來源的尿毒癥毒素與UA水平和腎功能參數(shù)有很強(qiáng)的正相關(guān)(圖3左)。差異菌群、差異代謝物和腎功能參數(shù)之間的相關(guān)性也顯示在網(wǎng)絡(luò)中(圖3右)。這些結(jié)果表明,UOX?/?大鼠腸道源性尿毒癥毒素的上調(diào)可能參與了HUA誘導(dǎo)的腎損傷。
隨后,作者通過糞菌移植等實(shí)驗(yàn)揭示了HUA微生物群在促進(jìn)腎損傷、觸發(fā)腎NLRP3炎癥小體的激活和損害腸屏障完整性中的作用,并證明HUA菌群激活NLRP3炎癥小體是I/R小鼠腎損傷和腸屏障損傷加劇的原因。

圖2. HUA大鼠腎臟中腸道源性尿毒癥毒素顯著增加

(圖源:Zhou, Xinghong et al., Microbiome. 2024)




圖3. 不同數(shù)據(jù)集聯(lián)合分析

(圖源:Zhou, Xinghong et al., Microbiome. 2024)

小結(jié)
作者首先通過敲除尿酸酶(UOX)建立HUA大鼠模型。HUA大鼠表現(xiàn)出明顯的腎功能障礙、腎小管損傷、纖維化、NLRP3炎癥小體活化和腸屏障功能受損。16S rRNA測(cè)序和功能預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)分析顯示異常的腸道微生物群和與尿毒癥毒素產(chǎn)生相關(guān)的途徑激活。代謝組學(xué)分析顯示HUA大鼠腎臟中明顯的腸道源性尿毒癥毒素積累。此外,作者還進(jìn)行了糞便菌群移植(FMT)來證實(shí)HUA誘導(dǎo)的腸道菌群失調(diào)對(duì)腎損傷的影響。在腎缺血/再灌注(I/R)手術(shù)后,HUA菌群再定殖的小鼠表現(xiàn)出嚴(yán)重的腎損傷和腸屏障功能受損。值得注意的是,在NLRP3敲除(NLRP3?/?)I/R小鼠中,HUA菌群對(duì)腎損傷和腸屏障的有害作用被消除。

拜譜小結(jié)
總之,多組學(xué)研究結(jié)果提供了HUA誘導(dǎo)的腸道菌群失調(diào)在腎損傷的發(fā)展中起重要作用的證據(jù)。此外,確定NLRP3的激活是這一過程的潛在中介。這些結(jié)果表明,靶向微生物群和NLRP3炎癥小體可能是治療腎臟疾病的一種有希望的策略。拜譜生物為本研究提供MT1000醫(yī)學(xué)全靶代謝組學(xué)檢測(cè)服務(wù)。拜譜生物自主研發(fā)的MT1000 kit具有高通量、高靈敏度、廣覆蓋度、定性定量準(zhǔn)確等特點(diǎn),提供最全的疾病分子數(shù)據(jù)庫,一次檢測(cè)可對(duì)1000+種醫(yī)學(xué)專屬性功能代謝物進(jìn)行準(zhǔn)確定性定量分析,適用于人、大鼠、小鼠等動(dòng)物來源的樣本,包括血液、細(xì)胞、糞便、組織等樣本類型。近期拜譜即將推出全新自研QMT1000醫(yī)學(xué)高通量靶向代謝組產(chǎn)品,可對(duì)1000+醫(yī)學(xué)專屬代謝物進(jìn)行絕對(duì)定量及組學(xué)分析,敬請(qǐng)期待!
參考文獻(xiàn):Zhou X,Ji S,Chen L, et al. Gut microbiota dysbiosis in hyperuricaemia promotes renal injury through the activation of NLRP3 inflammasome. Microbiome. 2024;12 (1):109. doi:10.1186/s40168-024-01826-9