脂化修飾是重要的翻譯后修飾方式,脂蛋白通常對(duì)磷脂雙分子層具有更高的親和力,從而對(duì)蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的定位、轉(zhuǎn)運(yùn)、蛋白之間的相互作用和穩(wěn)定性等產(chǎn)生重要影響。蛋白質(zhì)脂化存在多種形式,常見脂肪酸都可通過脂肪酸?;B接在蛋白質(zhì)的半胱氨酸、甘氨酸或賴氨酸等殘基上。
棕櫚酰化修飾根據(jù)連接方式可以分為S-棕櫚?;-棕櫚?;蚈-棕櫚酰化,其中S-棕櫚?;亲畛R姷牡鞍踪|(zhì)脂化修飾,也被稱為蛋白質(zhì)棕櫚?;?。可逆的棕櫚?;?/span>能夠動(dòng)態(tài)地調(diào)節(jié)底物蛋白的疏水性,從而在多種生理過程中發(fā)揮作用。隨著蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,極大地推動(dòng)了棕櫚?;揎椀难芯窟M(jìn)程,揭示了棕櫚酰化修飾對(duì)癌癥、糖尿病等人類疾病的重大影響。
2024年4-5月,Nature Cell Biology、Science Immunology、Nature雜志上三篇頂刊文章連發(fā),先后報(bào)道了棕櫚?;揎椪{(diào)控細(xì)胞焦亡過程的研究結(jié)果,突出了ROS在激活GSDMD過程中的重要性,并確定了ZDHHC家族酶在介導(dǎo)該修飾中的中心角色,揭示了棕櫚酰化修飾在調(diào)節(jié)GSDMD功能中的新機(jī)制,為未來的藥物開發(fā)和治療策略提供了新的視角。下面是我們總結(jié)的三篇文獻(xiàn)的主要研究成果,希望給您帶來新的研究思路。
第一篇研究發(fā)表在2024年4月10日,由哈佛醫(yī)學(xué)院的吳皓教授等人發(fā)表在Nature頂刊,論文題目為“ROS-dependent S-palmitoylation activates cleaved and intact gasdermin D”。該研究通過點(diǎn)擊化學(xué)、質(zhì)譜分析、電子顯微鏡等方法確認(rèn)了S-棕櫚?;荊SDMD激活的關(guān)鍵調(diào)控步驟,并且這一過程受到ROS的調(diào)控,進(jìn)一步揭示了GSDMD在炎癥性疾病和細(xì)胞死亡中的新機(jī)制,為未來的藥物開發(fā)和炎癥性疾病的治療提供了新的靶點(diǎn)。
英文題目:ROS-dependent S-palmitoylation activates cleaved and intact gasdermin D.
中文題目:依賴于ROS的棕櫚酰化作用激活剪切和未剪切的氣體門控蛋白D。
發(fā)表期刊:Nature
影響因子:50.5
發(fā)表時(shí)間:2024年5月
本研究發(fā)現(xiàn)GSDMD的Cys191位點(diǎn)發(fā)生S-棕櫚?;?,而棕櫚酰化對(duì)于孔洞的形成是必需的。S-棕櫚酰化不會(huì)影響GSDMD的切割,但會(huì)隨著線粒體產(chǎn)生的活性氧分子(ROS)而增強(qiáng)。在炎癥小體刺激或活性氧分子激活劑治療后,切割缺陷的GSDMD(D275A)也會(huì)發(fā)生棕櫚?;⒁鸺?xì)胞焦亡。棕櫚?;腉SDMD會(huì)誘導(dǎo)脂質(zhì)體泄漏并形成孔洞,這與冷凍電子顯微鏡顯示的GSDMD-NT孔洞結(jié)構(gòu)相似。ZDHHC5和ZDHHC9是主要的棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶,負(fù)責(zé)介導(dǎo)GSDMD的棕櫚酰化,它們的表達(dá)會(huì)受到炎癥小體激活和活性氧分子的影響而上調(diào)。研究結(jié)果表明可逆的棕櫚?;荊SDMD-NT和完整GSDMD形成孔道的檢查點(diǎn),作為激活這個(gè)孔道形成家族的通用開關(guān)。
總之,這篇文章揭示了GSDMD的S-棕櫚?;揎椩诩?xì)胞焦亡中的關(guān)鍵作用,發(fā)現(xiàn)ROS增強(qiáng)是激活GSDMD形成跨膜孔道的必需過程,為理解炎癥反映中的細(xì)胞死亡提供了重要的分子機(jī)制,并為未來的藥物開發(fā)提供了潛在的靶點(diǎn)。
圖1 GSDMD的棕櫚?;▓D源:Du G et al., Nature, 2024)
第二篇研究?jī)?nèi)容由哈佛醫(yī)學(xué)院的羅洪波研究團(tuán)隊(duì)完成。研究成果以“The palmitoylation of gasdermin D directs its membrane translocation and pore formation during pyroptosis”為題發(fā)表在Science Immunology期刊上。該研究通過免疫共沉淀、質(zhì)譜分析、點(diǎn)擊化學(xué)、脂質(zhì)結(jié)合實(shí)驗(yàn)等方法揭示GSDMD的棕櫚?;揎椇凸δ埽康氖翘剿鱃SDMD的棕櫚?;瘜?duì)其在細(xì)胞膜上的轉(zhuǎn)位和孔形成的影響,特別是在焦亡過程中。
英文題目:The palmitoylation of gasdermin D directs its membrane translocation and pore formation during pyroptosis.
中文題目:甘油二酯化后的氣體門控蛋白D會(huì)引導(dǎo)其在細(xì)胞凋亡過程中穿過膜層并形成孔洞。
發(fā)表期刊:Science Immunology
影響因子:17.6
發(fā)表時(shí)間:2024年3月
本研究通過蛋白質(zhì)組學(xué)方法,鑒定出脂肪酸合成酶(FASN)為GSDMD的結(jié)合伴侶。棕櫚?;竄DHHC5和ZDHHC9催化Cys/Cys(人/小鼠)位點(diǎn)的S-棕櫚酰化,并且在活性氧(ROS)的促進(jìn)下,直接介導(dǎo)GSDMD N端結(jié)構(gòu)域(GSDMD-NT)的膜轉(zhuǎn)位,但不影響全長(zhǎng)GSDMD(GSDMD-FL)的膜轉(zhuǎn)位。刺激物如脂多糖(LPS)可在炎癥體激活前誘導(dǎo)GSDMD-FL的棕櫚?;?,因此成為巨噬細(xì)胞激活的必要分子事件。結(jié)果表明抑制GSDMD棕櫚酰化可抑制巨噬細(xì)胞焦亡和IL-1β的釋放,減輕組織損傷,并增強(qiáng)感染小鼠的生存能力。因此,GSDMD-NT棕櫚酰化是控制GSDMD膜定位和激活的關(guān)鍵調(diào)節(jié)機(jī)制,這可能為調(diào)節(jié)感染和炎癥性疾病的免疫活動(dòng)提供額外的靶點(diǎn)。
總之,本研究通過揭示GSDMD棕櫚?;谡{(diào)控細(xì)胞焦亡中的核心作用,為開發(fā)針對(duì)炎癥性疾病和感染性疾病的新療法提供了重要的分子靶點(diǎn)和治療策略。
圖2 GSDMD與FASN相互作用,GSDMD-FL和GSDMD-NT棕櫚?;?/span>
(圖源:Balasubramanian A et al., Sci Immuno, 2024)
第三篇研究文章“A palmitoylation-depalmitoylation relay spatiotemporally controls GSDMD activation in pyroptosis.”由中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心許代超研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表于Nature Cell Biology期刊上。本文的主要研究目的是探究GSDMD在焦亡過程中的S-棕櫚?;揎椚绾螘r(shí)空調(diào)控其激活,以及這一修飾如何影響細(xì)胞膜定位、寡聚化和孔隙形成,從而揭示其在宿主防御和炎癥性疾病中的潛在應(yīng)用。
英文題目:A palmitoylation-depalmitoylation relay spatiotemporally controls GSDMD activation in pyroptosis.
中文題目:棕櫚?;?去棕櫚?;h(huán)在細(xì)胞焦亡過程中時(shí)空調(diào)控GSDMD的激活。
發(fā)表期刊:Nature Cell Biology
影響因子:17.3
發(fā)表時(shí)間:2024年3月
本研究發(fā)現(xiàn)GSDMD在細(xì)胞焦亡過程中可逆的發(fā)生棕櫚?;揎?,這一過程通過?;D(zhuǎn)移酶DHHC7介導(dǎo),并由去?;窤PT2逆轉(zhuǎn)。隨后,GSDMD-NT的棕櫚酰化促進(jìn)其向細(xì)胞膜的轉(zhuǎn)位,而APT2的去?;龠M(jìn)了GSDMD-NT的寡聚化和細(xì)胞膜上孔洞的形成,從而導(dǎo)致細(xì)胞焦亡和促炎細(xì)胞因子的釋放。此外,研究發(fā)現(xiàn)對(duì)棕櫚?;蛉プ貦磅;母蓴_會(huì)抑制焦亡,增加小鼠在脂多糖誘導(dǎo)的致命性膿毒癥中的存活率和細(xì)胞感染的敏感性。
總之,這些結(jié)果揭示了棕櫚?;?去酰基化接力在時(shí)空上控制GSDMD激活的新模式,為理解細(xì)胞焦亡的調(diào)控機(jī)制提供了重要見解,并可能為相關(guān)疾病的治療提供新的靶點(diǎn)。
圖3 GSDMD在響應(yīng)LPS時(shí)被S-棕櫚?;?/span>
(圖源:Zhang N et al., Nat Cell Biol, 2024)
小結(jié)
以上三篇文獻(xiàn)均聚焦于GSDMD的S-棕櫚?;揎椩诩?xì)胞焦亡中的作用。第一篇文獻(xiàn)揭示了GSDMD的S-棕櫚?;瘯r(shí)膜轉(zhuǎn)位和孔形成的關(guān)鍵調(diào)控機(jī)制,這一過程由棕櫚?;D(zhuǎn)移酶(如ZDHHC5和ZDHHHC9)介導(dǎo),且受ROS調(diào)控。第二篇文獻(xiàn)進(jìn)一步闡明了GSDMD在細(xì)胞焦亡中的時(shí)空調(diào)控機(jī)制,發(fā)現(xiàn)GSDMD的S-棕櫚?;腿プ貦磅;ㄟ^一個(gè)接力過程精確控制其激活。第三篇文獻(xiàn)提出了即使未經(jīng)炎癥性半胱天冬酶切割,GSDMD的S-棕櫚?;材芗せ畈⑿纬赡た椎男掠^點(diǎn),強(qiáng)調(diào)了可逆棕櫚酰化作為GSDMD家族激活的通用開關(guān)。總之,這些研究不僅深化了對(duì)GSDMD在炎癥和細(xì)胞死亡中作用的理解,也為治療相關(guān)疾病提供了新的潛在靶點(diǎn)。
拜譜小結(jié)
棕櫚?;侵匾闹|(zhì)化修飾形式,一般發(fā)生在半胱氨酸殘基上。棕櫚?;揎椬钪匾墓δ苁窃鰪?qiáng)可通行蛋白與膜的親和性,從而調(diào)控蛋白質(zhì)的定位與功能。拜譜作為國(guó)內(nèi)領(lǐng)先的多組學(xué)服務(wù)公司,可提供基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組等多組學(xué)服務(wù),其中棕櫚?;揎椀鞍踪|(zhì)組是我司重磅特色產(chǎn)品,已經(jīng)積累了豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),目前在高端Astral質(zhì)譜儀的加持下,不同樣品的棕櫚?;揎椢稽c(diǎn)平均檢出量可達(dá)20000+,最高已突破40000+,助力客戶解決科學(xué)難題。除此之外,拜譜生物還可提供半胱氨酸系列產(chǎn)品,包括亞硝基化、谷胱甘肽化、硫巰基化、次磺酸化、total氧化還原、游離巰基,歡迎大家咨詢!
參考文獻(xiàn):
[1] Du G, Healy LB, David L, et al. ROS-dependent S-palmitoylation activates cleaved and intact gasdermin D. Nature. 2024;630(8016):437-446. doi: 10.1038/s41586-024-07373-5B1
[2] Balasubramanian A, Hsu AY, Ghimire L, et al. The palmitoylation of gasdermin D directs its membrane translocation and pore formation during pyroptosis. Sci Immunol. 2024;9(94):eadn1452. doi: 10.1126/sciimmunol.adn1452B1
[3] Zhang N, Zhang J, Yang Y, et al. A palmitoylation-depalmitoylation relay spatiotemporally controls GSDMD activation in pyroptosis. Nat Cell Biol. 2024;26(5):757-769. doi: 10.1038/s41556-024-01397-9